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    1、控制對象
    工業潔凈室以無生命微粒（包括無機微粒和有機微粒）為控制對象。
    生物潔凈室以有生命微粒(單細胞藻類、菌類、原生動物、細菌和病毒等)為控制對象。
    2、應用行業
    工業凈化車間主要應用于電子工業(集成電路、精密電子、光電行業等)、印刷工業、精密工業、原子能工業等。
    生物潔凈車間主要應用于無菌手術室、病房、制藥潔凈車間、化妝品生產凈化車間、食品行業生產車間、醫學實驗室等及要求控制室內細菌含量的無菌潔凈場合。
    3、壓差控制
    生物潔凈車間又分為一般生物潔凈室和生物安全潔凈室(如青霉素生產車間、艾滋病防治的研究實驗室等)，一般生物潔凈室的壓差為正壓，生物安全潔凈室為負壓。
    關于一般生物潔凈車間和生物安全潔凈車間的區別可參照：http://www.flash-work.cn/news-shows-czo1OiIzNjh8MSI7.html
    工業潔凈車間壓差一般為正壓。
    4、清潔方式

    生物潔凈車間和工業潔凈車間都要應用清除空氣中微粒的原理，因此在本質上它們是一樣的，所不同的是控制參數中增加了控制室內細菌的濃度。在一般情況下，潔凈度、細菌的濃度較之溫度、濕度的控制更為重要。而細菌本身是有大小的，且細菌多以塵粒為寄存體，因此采用空氣凈化措施，控制室內的潔凈度就能控制室內的含菌量，到達無菌的目的，當然還要采取一些其他凈化措施。對于付于表面的微粒，工業潔凈室一般采用擦洗的方法就可大大減少表面上的微粒數量，而生物潔凈室是針對有生命的微粒，一般擦洗可能給微粒帶來生命和營養，反而促進其繁殖，增加微粒菌類的數量。因此，對于生物潔凈室來說，必須用表面消毒的辦法來取代一般的擦洗。